Se tendría pensado gravar la prima de comercio justo con Impuesto a la Renta. Ante esto, distintos gremios de agroexportadores han mostrado su inconformidad aduciendo que esta prima no se recibe como una donación sino como retribución por las operaciones que se deben realizar a los cultivos y las cadenas de comercialización para que puedan alcanzar la certificación de Comercio Justo.
Según la Junta Nacional del Café, esta medida podría crear nuevos conflictos sociales, dado que afectaría a más de 146 organizaciones, que reúnen más de 100 mil productores a nivel nacional; además de desincentivar la organización empresarial en los pequeños productores.