De acuerdo a un estudio de la Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO), los países de Perú, Chile y Ecuador podrían ver una menor productividad en la pesca y una mayor frecuencia de los fenómenos de El Niño y La Niña, debido al impacto del cambio climático sobre la corriente de Humboldt. Esto se debería a que la productividad de los peces está controlada principalmente por el clima, el cual tiene efectos en la producción de fitoplancton (base de toda la cadena alimentaria).
En este contexto, el estudio proyecta una disminución general en la abundancia de fitoplancton y zooplancton para la corriente de Humboldt, como resultado de un agotamiento de nutrientes a gran escala en el agua subsuperficial, debido a un clima más cálido. No obstante, la FAO instó a institucionalizar sistemas participativos de gobernanza, promover estudios científicos especializados y mejorar el monitoreo, que permitirán mejorar la adaptación de la pesca en pequeña escala para hacer frente al cambio climático.